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如何選擇多肽合成的樹脂類型?第二部分

文章出處:北京華銳捷科技有限公司   責(zé)任編輯:北京發(fā)電機(jī)設(shè)備租賃   發(fā)布時(shí)間:2024-12-6 11:46:14    點(diǎn)擊數(shù):5123   【

對于多肽的固相合成而言,固相樹脂在成分和官能團(tuán)的差異化往往會導(dǎo)致合成的結(jié)果千差萬別,上一節(jié),我們已經(jīng)討論了樹脂載樣量對于多肽合成的影響。今天我們將要討論數(shù)值的親水性以及溶脹現(xiàn)象對多肽合成帶來的影響。


多肽合成中,我們需要知道,隨著肽鏈的延長,體系內(nèi)聚合的概率會明顯增大,使得長鏈肽的合成越來越難。其中一個(gè)去提高產(chǎn)率的方法就是去使用低負(fù)載量的樹脂(見第一部分),還有另外一種方法就是選擇一種具有較高溶脹能力和親水性的樹脂,比如ChemMatrix®聚乙二醇樹脂,目前這類樹脂得到了業(yè)界非常大的關(guān)注。


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Figure1:兩種樹脂的比較A) ChemMatrix®聚乙二醇樹脂;B)常見的聚苯乙烯樹脂;C)固相合成中,不同溶劑條件下,溶脹能力的比較。


為了能夠更充分的了解和探討樹脂之間的差異化,我們翻閱了Garcia-Ramos教授在JournalofPeptideScience發(fā)表的名為ChemMatrix®forcomplexpeptidesand combinatorialchemistry這篇文章,Garcia-Ramos教授合成了具有28個(gè)氨基酸的長鏈肽Thermolysinα1,由于此多肽非常容易分子內(nèi)聚合,使得合成難度大大增加,雖然Garcia-Ramos教授是手動一步步將Thermolysinα1得到,但是我們希望通過Biotage®Initiator+Alstra™全自動微波多肽合成儀將其進(jìn)行自動化合成。


首先,我們使用聚苯乙烯樹脂(0.6mmol/gRink氨基)來進(jìn)行Thermolysin多肽的合成,和之前我們的建議相比,0.6mmo/g的數(shù)值是偏高的,之所以選擇這個(gè)載樣量,是為了和下面使用的ChemMatrix樹脂做對比。


在DIC/Oxyma的活化條件下,單模加熱到75℃, 反應(yīng)5分鐘,F(xiàn)igure2.


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Figure2:合成得到的Thermolysin多肽的粗產(chǎn)物分析


乍一看粗產(chǎn)物的紫外吸收譜圖,以為是拿到了反應(yīng)產(chǎn)物,但當(dāng)我們進(jìn)一步用質(zhì)譜進(jìn)一步證實(shí)之后發(fā)現(xiàn),最大豐度的離子峰和112Da相關(guān),它比目標(biāo)化合物更輕,疑似是丟失Ile片段所致,F(xiàn)igure3.


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在得到了這些實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)之后,我們重復(fù)了之前的實(shí)驗(yàn),還是之前的方法和實(shí)驗(yàn)條件,只是我們將樹脂改成了具有更好的溶脹以及親水性能的ChemMatrix樹脂,實(shí)驗(yàn)起始幾步的檢測結(jié)果讓我們有點(diǎn)擔(dān)心效果也會有影響,但是之后的整體的情況會好得多,主峰和目標(biāo)肽幾乎用著相同的保留時(shí)間,F(xiàn)igure4。


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之后,我們對主峰做了進(jìn)一步的質(zhì)譜檢測,發(fā)現(xiàn)其質(zhì)荷比完全符合目標(biāo)多肽的描述(Figure5),同時(shí)我們粗略計(jì)算了一下其純度,大概在65%左右(這很有可能是由于體系中還殘留有保護(hù)基團(tuán))。


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這一結(jié)果令人振奮!仔細(xì)分析這兩個(gè)不同類型樹脂的對比實(shí)驗(yàn),我們可以發(fā)現(xiàn)ChemMatrix樹脂的溶脹程度比聚苯乙烯大得多,這使得官能團(tuán)在空間上彼此遠(yuǎn)離,從而減少了在肽鏈生長時(shí)發(fā)生共聚的可能性。另外一方面就是樹脂本身的親水性了,由于聚苯乙烯樹脂強(qiáng)烈的疏水性使得多肽和樹脂更多的作用而減少了溶劑中的鏈增長;而對于聚乙二醇樹脂來說,其表面具有極性醚鍵,更好的親水性,它會排斥肽鏈,從而提高合成成功的可能性。


以上實(shí)驗(yàn),可以發(fā)現(xiàn),在合成多肽的過程中,樹脂種類的選擇至關(guān)重要。在進(jìn)行多肽合成的條件優(yōu)化的時(shí)候,往往我們可以很簡單地通過改變樹脂的種類來進(jìn)行條件優(yōu)化,反而會更容易得到長鏈肽。這也是我們在合成多肽時(shí)候的一個(gè)非常好的優(yōu)化思路。


未來,我們將會持續(xù)使用ChemMatrix樹脂或者其他聚乙二醇類樹脂, 因?yàn)樗哂懈玫娜苊浐陀H水性。



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